Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcnma1Q08460 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcnma1Q08460 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcnma1Q08460 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcnma1Q08460 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcnma1Q08460 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnma1Q08460 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnma1Q08460 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnma1Q08460 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnma1Q08460 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kcnma1Q08460 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Kcnma1Q08460 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kcnma1Q08460 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kcnma1Q08460 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kcnma1Q08460 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kcnma1Q08460 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kcnma1Q08460 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kcnma1Q08460 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kcnma1Q08460 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kcnma1Q08460 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kcnma1Q08460 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kcnma1Q08460 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kcnma1Q08460 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcnma1Q08460 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcnma1Q08460 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcnma1Q08460 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kcnma1Q08460 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kcnma1Q08460 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kcnma1Q08460 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kcnma1Q08460 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcnma1Q08460 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcnma1Q08460 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcnma1Q08460 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcnma1Q08460 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kcnma1Q08460 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kcnma1Q08460 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kcnma1Q08460 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcnma1Q08460 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcnma1Q08460 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcnma1Q08460 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcnma1Q08460 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcnma1Q08460 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kcnma1Q08460 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kcnma1Q08460 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Kcnma1Q08460 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kcnma1Q08460 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kcnma1Q08460 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kcnma1Q08460 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Kcnma1Q08460 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcnma1Q08460 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kcnma1Q08460 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kcnma1Q08460 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kcnma1Q08460 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kcnma1Q08460 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kcnma1Q08460 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kcnma1Q08460 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kcnma1Q08460 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kcnma1Q08460 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kcnma1Q08460 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kcnma1Q08460 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kcnma1Q08460 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kcnma1Q08460 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kcnma1Q08460 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kcnma1Q08460 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Kcnma1Q08460 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kcnma1Q08460 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kcnma1Q08460 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kcnma1Q08460 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Kcnma1Q08460 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kcnma1Q08460 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kcnma1Q08460 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kcnma1Q08460 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kcnma1Q08460 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kcnma1Q08460 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kcnma1Q08460 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kcnma1Q08460 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms