Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NrepQ07475 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NrepQ07475 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NrepQ07475 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NrepQ07475 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NrepQ07475 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NrepQ07475 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrepQ07475 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NrepQ07475 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrepQ07475 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrepQ07475 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrepQ07475 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NrepQ07475 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrepQ07475 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NrepQ07475 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NrepQ07475 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NrepQ07475 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NrepQ07475 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NrepQ07475 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NrepQ07475 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NrepQ07475 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NrepQ07475 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NrepQ07475 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NrepQ07475 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NrepQ07475 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NrepQ07475 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NrepQ07475 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NrepQ07475 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NrepQ07475 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NrepQ07475 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NrepQ07475 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NrepQ07475 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NrepQ07475 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NrepQ07475 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NrepQ07475 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NrepQ07475 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NrepQ07475 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrepQ07475 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NrepQ07475 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NrepQ07475 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NrepQ07475 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NrepQ07475 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NrepQ07475 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NrepQ07475 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NrepQ07475 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NrepQ07475 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NrepQ07475 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms