Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Caprin2Q05A80 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Caprin2Q05A80 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Caprin2Q05A80 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Caprin2Q05A80 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Caprin2Q05A80 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Caprin2Q05A80 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Caprin2Q05A80 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Caprin2Q05A80 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Caprin2Q05A80 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Caprin2Q05A80 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Caprin2Q05A80 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caprin2Q05A80 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Caprin2Q05A80 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caprin2Q05A80 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caprin2Q05A80 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Caprin2Q05A80 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Caprin2Q05A80 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Caprin2Q05A80 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Caprin2Q05A80 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Caprin2Q05A80 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Caprin2Q05A80 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Caprin2Q05A80 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Caprin2Q05A80 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Caprin2Q05A80 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Caprin2Q05A80 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Caprin2Q05A80 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Caprin2Q05A80 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Caprin2Q05A80 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Caprin2Q05A80 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Caprin2Q05A80 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Caprin2Q05A80 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Caprin2Q05A80 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Caprin2Q05A80 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Caprin2Q05A80 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Caprin2Q05A80 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Caprin2Q05A80 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Caprin2Q05A80 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Caprin2Q05A80 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Caprin2Q05A80 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Caprin2Q05A80 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Caprin2Q05A80 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Caprin2Q05A80 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Caprin2Q05A80 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Caprin2Q05A80 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Caprin2Q05A80 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Caprin2Q05A80 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Caprin2Q05A80 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Caprin2Q05A80 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Caprin2Q05A80 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Caprin2Q05A80 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Caprin2Q05A80 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Caprin2Q05A80 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Caprin2Q05A80 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms