Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col9a1Q05722 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col9a1Q05722 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Col9a1Q05722 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col9a1Q05722 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col9a1Q05722 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col9a1Q05722 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col9a1Q05722 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col9a1Q05722 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Col9a1Q05722 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col9a1Q05722 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col9a1Q05722 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Col9a1Q05722 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col9a1Q05722 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col9a1Q05722 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col9a1Q05722 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col9a1Q05722 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Col9a1Q05722 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col9a1Q05722 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col9a1Q05722 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col9a1Q05722 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col9a1Q05722 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col9a1Q05722 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col9a1Q05722 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col9a1Q05722 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col9a1Q05722 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col9a1Q05722 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col9a1Q05722 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col9a1Q05722 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col9a1Q05722 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col9a1Q05722 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col9a1Q05722 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col9a1Q05722 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col9a1Q05722 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col9a1Q05722 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col9a1Q05722 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col9a1Q05722 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col9a1Q05722 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col9a1Q05722 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col9a1Q05722 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col9a1Q05722 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col9a1Q05722 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col9a1Q05722 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col9a1Q05722 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col9a1Q05722 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col9a1Q05722 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col9a1Q05722 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col9a1Q05722 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col9a1Q05722 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col9a1Q05722 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Col9a1Q05722 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col9a1Q05722 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col9a1Q05722 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Col9a1Q05722 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Col9a1Q05722 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Col9a1Q05722 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col9a1Q05722 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col9a1Q05722 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col9a1Q05722 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col9a1Q05722 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col9a1Q05722 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col9a1Q05722 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col9a1Q05722 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col9a1Q05722 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col9a1Q05722 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col9a1Q05722 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col9a1Q05722 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Col9a1Q05722 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col9a1Q05722 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col9a1Q05722 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col9a1Q05722 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms