Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoc2Q05020 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoc2Q05020 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoc2Q05020 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoc2Q05020 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoc2Q05020 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoc2Q05020 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoc2Q05020 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoc2Q05020 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoc2Q05020 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoc2Q05020 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoc2Q05020 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoc2Q05020 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apoc2Q05020 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apoc2Q05020 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoc2Q05020 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoc2Q05020 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoc2Q05020 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoc2Q05020 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoc2Q05020 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoc2Q05020 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoc2Q05020 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoc2Q05020 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoc2Q05020 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoc2Q05020 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoc2Q05020 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoc2Q05020 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoc2Q05020 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoc2Q05020 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoc2Q05020 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apoc2Q05020 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apoc2Q05020 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apoc2Q05020 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoc2Q05020 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoc2Q05020 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoc2Q05020 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoc2Q05020 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoc2Q05020 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apoc2Q05020 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoc2Q05020 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms