Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RelaQ04207 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RelaQ04207 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RelaQ04207 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RelaQ04207 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RelaQ04207 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RelaQ04207 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RelaQ04207 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RelaQ04207 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RelaQ04207 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RelaQ04207 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RelaQ04207 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RelaQ04207 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RelaQ04207 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RelaQ04207 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RelaQ04207 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RelaQ04207 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RelaQ04207 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RelaQ04207 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RelaQ04207 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RelaQ04207 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RelaQ04207 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RelaQ04207 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RelaQ04207 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RelaQ04207 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RelaQ04207 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RelaQ04207 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RelaQ04207 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RelaQ04207 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RelaQ04207 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RelaQ04207 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RelaQ04207 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RelaQ04207 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RelaQ04207 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RelaQ04207 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RelaQ04207 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RelaQ04207 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RelaQ04207 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RelaQ04207 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RelaQ04207 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RelaQ04207 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RelaQ04207 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RelaQ04207 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RelaQ04207 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RelaQ04207 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RelaQ04207 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RelaQ04207 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RelaQ04207 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RelaQ04207 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RelaQ04207 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RelaQ04207 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RelaQ04207 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RelaQ04207 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RelaQ04207 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RelaQ04207 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RelaQ04207 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RelaQ04207 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RelaQ04207 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RelaQ04207 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RelaQ04207 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RelaQ04207 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RelaQ04207 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RelaQ04207 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RelaQ04207 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RelaQ04207 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RelaQ04207 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RelaQ04207 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RelaQ04207 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RelaQ04207 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RelaQ04207 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RelaQ04207 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RelaQ04207 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RelaQ04207 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RelaQ04207 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RelaQ04207 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RelaQ04207 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RelaQ04207 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RelaQ04207 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RelaQ04207 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RelaQ04207 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RelaQ04207 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RelaQ04207 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RelaQ04207 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RelaQ04207 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms