Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pax5Q02650 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pax5Q02650 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pax5Q02650 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pax5Q02650 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pax5Q02650 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pax5Q02650 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pax5Q02650 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pax5Q02650 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pax5Q02650 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax5Q02650 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pax5Q02650 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pax5Q02650 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pax5Q02650 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pax5Q02650 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax5Q02650 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax5Q02650 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax5Q02650 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax5Q02650 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax5Q02650 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax5Q02650 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax5Q02650 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pax5Q02650 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pax5Q02650 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pax5Q02650 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pax5Q02650 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pax5Q02650 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pax5Q02650 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pax5Q02650 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms