Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RykQ01887 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RykQ01887 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RykQ01887 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RykQ01887 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RykQ01887 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RykQ01887 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RykQ01887 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RykQ01887 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RykQ01887 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RykQ01887 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RykQ01887 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RykQ01887 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RykQ01887 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RykQ01887 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RykQ01887 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RykQ01887 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RykQ01887 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RykQ01887 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RykQ01887 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RykQ01887 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RykQ01887 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RykQ01887 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RykQ01887 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RykQ01887 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RykQ01887 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RykQ01887 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RykQ01887 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RykQ01887 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RykQ01887 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RykQ01887 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RykQ01887 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RykQ01887 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RykQ01887 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RykQ01887 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RykQ01887 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RykQ01887 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RykQ01887 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RykQ01887 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RykQ01887 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RykQ01887 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RykQ01887 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RykQ01887 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RykQ01887 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RykQ01887 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RykQ01887 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RykQ01887 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RykQ01887 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RykQ01887 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RykQ01887 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RykQ01887 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RykQ01887 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RykQ01887 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RykQ01887 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RykQ01887 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RykQ01887 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RykQ01887 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RykQ01887 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RykQ01887 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RykQ01887 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RykQ01887 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RykQ01887 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RykQ01887 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RykQ01887 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RykQ01887 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RykQ01887 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RykQ01887 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RykQ01887 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RykQ01887 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RykQ01887 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RykQ01887 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RykQ01887 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RykQ01887 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RykQ01887 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RykQ01887 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RykQ01887 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RykQ01887 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RykQ01887 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RykQ01887 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RykQ01887 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RykQ01887 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RykQ01887 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RykQ01887 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RykQ01887 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RykQ01887 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RykQ01887 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RykQ01887 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RykQ01887 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RykQ01887 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RykQ01887 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RykQ01887 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RykQ01887 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RykQ01887 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RykQ01887 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RykQ01887 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RykQ01887 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RykQ01887 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RykQ01887 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RykQ01887 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RykQ01887 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms