Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RykQ01887 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RykQ01887 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RykQ01887 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RykQ01887 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RykQ01887 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RykQ01887 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RykQ01887 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RykQ01887 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RykQ01887 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RykQ01887 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RykQ01887 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RykQ01887 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RykQ01887 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RykQ01887 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RykQ01887 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RykQ01887 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RykQ01887 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RykQ01887 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RykQ01887 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RykQ01887 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RykQ01887 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RykQ01887 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RykQ01887 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RykQ01887 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RykQ01887 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RykQ01887 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RykQ01887 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RykQ01887 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RykQ01887 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RykQ01887 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RykQ01887 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RykQ01887 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RykQ01887 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RykQ01887 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RykQ01887 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RykQ01887 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RykQ01887 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RykQ01887 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RykQ01887 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RykQ01887 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RykQ01887 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RykQ01887 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RykQ01887 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RykQ01887 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RykQ01887 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RykQ01887 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RykQ01887 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RykQ01887 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RykQ01887 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RykQ01887 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RykQ01887 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RykQ01887 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RykQ01887 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RykQ01887 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RykQ01887 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RykQ01887 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RykQ01887 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RykQ01887 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RykQ01887 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RykQ01887 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RykQ01887 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RykQ01887 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RykQ01887 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RykQ01887 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RykQ01887 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RykQ01887 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RykQ01887 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RykQ01887 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RykQ01887 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RykQ01887 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RykQ01887 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RykQ01887 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RykQ01887 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RykQ01887 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RykQ01887 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RykQ01887 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RykQ01887 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RykQ01887 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RykQ01887 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RykQ01887 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RykQ01887 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RykQ01887 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RykQ01887 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RykQ01887 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RykQ01887 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RykQ01887 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RykQ01887 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RykQ01887 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RykQ01887 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RykQ01887 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RykQ01887 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RykQ01887 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RykQ01887 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RykQ01887 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RykQ01887 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RykQ01887 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RykQ01887 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RykQ01887 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RykQ01887 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms