Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrcdQ00LT2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PrcdQ00LT2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrcdQ00LT2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrcdQ00LT2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrcdQ00LT2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrcdQ00LT2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms