Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gjb2Q00977 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gjb2Q00977 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gjb2Q00977 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gjb2Q00977 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gjb2Q00977 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gjb2Q00977 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gjb2Q00977 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gjb2Q00977 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gjb2Q00977 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gjb2Q00977 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gjb2Q00977 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gjb2Q00977 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gjb2Q00977 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gjb2Q00977 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Gjb2Q00977 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gjb2Q00977 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gjb2Q00977 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gjb2Q00977 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gjb2Q00977 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gjb2Q00977 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gjb2Q00977 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gjb2Q00977 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gjb2Q00977 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gjb2Q00977 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gjb2Q00977 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gjb2Q00977 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Gjb2Q00977 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gjb2Q00977 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gjb2Q00977 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gjb2Q00977 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gjb2Q00977 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gjb2Q00977 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gjb2Q00977 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gjb2Q00977 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gjb2Q00977 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gjb2Q00977 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gjb2Q00977 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gjb2Q00977 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gjb2Q00977 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gjb2Q00977 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gjb2Q00977 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gjb2Q00977 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gjb2Q00977 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gjb2Q00977 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gjb2Q00977 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gjb2Q00977 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gjb2Q00977 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gjb2Q00977 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gjb2Q00977 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Gjb2Q00977 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gjb2Q00977 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gjb2Q00977 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gjb2Q00977 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gjb2Q00977 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gjb2Q00977 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gjb2Q00977 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gjb2Q00977 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gjb2Q00977 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gjb2Q00977 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gjb2Q00977 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gjb2Q00977 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gjb2Q00977 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gjb2Q00977 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gjb2Q00977 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gjb2Q00977 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gjb2Q00977 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gjb2Q00977 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gjb2Q00977 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gjb2Q00977 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gjb2Q00977 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gjb2Q00977 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gjb2Q00977 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gjb2Q00977 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gjb2Q00977 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gjb2Q00977 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gjb2Q00977 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gjb2Q00977 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gjb2Q00977 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gjb2Q00977 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gjb2Q00977 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gjb2Q00977 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gjb2Q00977 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gjb2Q00977 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms