Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LystP97412 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LystP97412 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LystP97412 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LystP97412 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LystP97412 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LystP97412 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LystP97412 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LystP97412 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LystP97412 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LystP97412 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LystP97412 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LystP97412 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LystP97412 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LystP97412 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LystP97412 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LystP97412 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LystP97412 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LystP97412 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LystP97412 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LystP97412 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LystP97412 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LystP97412 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LystP97412 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LystP97412 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LystP97412 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LystP97412 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LystP97412 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LystP97412 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LystP97412 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LystP97412 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LystP97412 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LystP97412 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LystP97412 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LystP97412 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LystP97412 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LystP97412 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LystP97412 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LystP97412 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LystP97412 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LystP97412 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LystP97412 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LystP97412 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LystP97412 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LystP97412 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LystP97412 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LystP97412 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LystP97412 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LystP97412 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LystP97412 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LystP97412 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LystP97412 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LystP97412 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LystP97412 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LystP97412 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LystP97412 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LystP97412 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LystP97412 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LystP97412 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LystP97412 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LystP97412 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LystP97412 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LystP97412 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LystP97412 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LystP97412 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LystP97412 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LystP97412 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LystP97412 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LystP97412 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LystP97412 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LystP97412 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LystP97412 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LystP97412 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LystP97412 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LystP97412 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LystP97412 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LystP97412 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LystP97412 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LystP97412 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LystP97412 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LystP97412 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LystP97412 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LystP97412 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LystP97412 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LystP97412 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LystP97412 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LystP97412 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LystP97412 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LystP97412 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LystP97412 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LystP97412 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LystP97412 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LystP97412 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LystP97412 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LystP97412 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LystP97412 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LystP97412 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LystP97412 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LystP97412 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LystP97412 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms