Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LystP97412 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LystP97412 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LystP97412 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LystP97412 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LystP97412 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LystP97412 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LystP97412 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LystP97412 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LystP97412 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LystP97412 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LystP97412 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LystP97412 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LystP97412 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LystP97412 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LystP97412 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LystP97412 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LystP97412 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LystP97412 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LystP97412 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LystP97412 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LystP97412 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LystP97412 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LystP97412 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LystP97412 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LystP97412 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LystP97412 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LystP97412 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LystP97412 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LystP97412 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LystP97412 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LystP97412 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LystP97412 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LystP97412 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LystP97412 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LystP97412 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LystP97412 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LystP97412 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LystP97412 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LystP97412 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LystP97412 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LystP97412 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LystP97412 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LystP97412 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LystP97412 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LystP97412 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LystP97412 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LystP97412 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LystP97412 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LystP97412 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LystP97412 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LystP97412 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LystP97412 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LystP97412 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LystP97412 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LystP97412 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LystP97412 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LystP97412 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LystP97412 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LystP97412 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LystP97412 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LystP97412 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LystP97412 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LystP97412 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LystP97412 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LystP97412 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LystP97412 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LystP97412 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LystP97412 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LystP97412 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LystP97412 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LystP97412 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LystP97412 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LystP97412 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LystP97412 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LystP97412 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LystP97412 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LystP97412 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LystP97412 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LystP97412 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LystP97412 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LystP97412 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LystP97412 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LystP97412 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LystP97412 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LystP97412 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LystP97412 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LystP97412 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LystP97412 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LystP97412 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LystP97412 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LystP97412 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LystP97412 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LystP97412 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LystP97412 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LystP97412 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LystP97412 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LystP97412 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LystP97412 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LystP97412 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms