Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps45P97390 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Vps45P97390 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps45P97390 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps45P97390 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps45P97390 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vps45P97390 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps45P97390 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps45P97390 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps45P97390 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps45P97390 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps45P97390 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps45P97390 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps45P97390 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps45P97390 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps45P97390 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps45P97390 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps45P97390 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps45P97390 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps45P97390 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps45P97390 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps45P97390 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps45P97390 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps45P97390 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps45P97390 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps45P97390 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps45P97390 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps45P97390 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps45P97390 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps45P97390 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps45P97390 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps45P97390 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps45P97390 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps45P97390 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps45P97390 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps45P97390 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps45P97390 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps45P97390 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps45P97390 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps45P97390 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps45P97390 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps45P97390 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps45P97390 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps45P97390 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps45P97390 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps45P97390 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps45P97390 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps45P97390 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps45P97390 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps45P97390 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps45P97390 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps45P97390 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps45P97390 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps45P97390 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps45P97390 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps45P97390 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps45P97390 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps45P97390 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps45P97390 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps45P97390 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps45P97390 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps45P97390 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps45P97390 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps45P97390 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps45P97390 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps45P97390 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps45P97390 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps45P97390 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps45P97390 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps45P97390 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps45P97390 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps45P97390 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps45P97390 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps45P97390 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps45P97390 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms