Protein–RNA interactions for Protein: P97382

Kcnab3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab3P97382 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnab3P97382 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnab3P97382 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnab3P97382 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnab3P97382 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnab3P97382 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnab3P97382 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnab3P97382 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnab3P97382 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kcnab3P97382 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kcnab3P97382 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnab3P97382 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnab3P97382 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcnab3P97382 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnab3P97382 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnab3P97382 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnab3P97382 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnab3P97382 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnab3P97382 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnab3P97382 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnab3P97382 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnab3P97382 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnab3P97382 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnab3P97382 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnab3P97382 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnab3P97382 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnab3P97382 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnab3P97382 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnab3P97382 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms