Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Pkp1P97350 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Pkp1P97350 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Pkp1P97350 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Pkp1P97350 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Pkp1P97350 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Pkp1P97350 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Pkp1P97350 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Pkp1P97350 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Pkp1P97350 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Pkp1P97350 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Pkp1P97350 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Pkp1P97350 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Pkp1P97350 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Pkp1P97350 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Pkp1P97350 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Pkp1P97350 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Pkp1P97350 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Pkp1P97350 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Pkp1P97350 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Pkp1P97350 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Pkp1P97350 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Pkp1P97350 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Pkp1P97350 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Pkp1P97350 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Pkp1P97350 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Pkp1P97350 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Pkp1P97350 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Pkp1P97350 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Pkp1P97350 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Pkp1P97350 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Pkp1P97350 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Pkp1P97350 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Pkp1P97350 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Pkp1P97350 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Pkp1P97350 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Pkp1P97350 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Pkp1P97350 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Pkp1P97350 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Pkp1P97350 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Pkp1P97350 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Pkp1P97350 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Pkp1P97350 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Pkp1P97350 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Pkp1P97350 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Pkp1P97350 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Pkp1P97350 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Pkp1P97350 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Pkp1P97350 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Pkp1P97350 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Pkp1P97350 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Pkp1P97350 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Pkp1P97350 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Pkp1P97350 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Pkp1P97350 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Pkp1P97350 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Pkp1P97350 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Pkp1P97350 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Pkp1P97350 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Pkp1P97350 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Pkp1P97350 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Pkp1P97350 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Pkp1P97350 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,89■■■□□ 2,22
Pkp1P97350 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28,89■■■□□ 2,21
Pkp1P97350 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Pkp1P97350 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Pkp1P97350 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Pkp1P97350 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Pkp1P97350 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Pkp1P97350 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Pkp1P97350 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Pkp1P97350 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Pkp1P97350 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Pkp1P97350 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Pkp1P97350 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Pkp1P97350 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Pkp1P97350 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Pkp1P97350 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Pkp1P97350 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Pkp1P97350 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Pkp1P97350 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Pkp1P97350 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Pkp1P97350 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Pkp1P97350 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Pkp1P97350 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms