Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arf1P84078 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arf1P84078 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arf1P84078 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arf1P84078 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arf1P84078 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arf1P84078 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arf1P84078 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arf1P84078 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arf1P84078 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arf1P84078 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arf1P84078 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arf1P84078 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf1P84078 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arf1P84078 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arf1P84078 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arf1P84078 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arf1P84078 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arf1P84078 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arf1P84078 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms