Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TnikP83510 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TnikP83510 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TnikP83510 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TnikP83510 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TnikP83510 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TnikP83510 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TnikP83510 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TnikP83510 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TnikP83510 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TnikP83510 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TnikP83510 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TnikP83510 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TnikP83510 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TnikP83510 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TnikP83510 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TnikP83510 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TnikP83510 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TnikP83510 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TnikP83510 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TnikP83510 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TnikP83510 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TnikP83510 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TnikP83510 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TnikP83510 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TnikP83510 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TnikP83510 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TnikP83510 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TnikP83510 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TnikP83510 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TnikP83510 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TnikP83510 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TnikP83510 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TnikP83510 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TnikP83510 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TnikP83510 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TnikP83510 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TnikP83510 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TnikP83510 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TnikP83510 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TnikP83510 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TnikP83510 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TnikP83510 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TnikP83510 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TnikP83510 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TnikP83510 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TnikP83510 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TnikP83510 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TnikP83510 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TnikP83510 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TnikP83510 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TnikP83510 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TnikP83510 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TnikP83510 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TnikP83510 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TnikP83510 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TnikP83510 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TnikP83510 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TnikP83510 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
TnikP83510 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TnikP83510 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TnikP83510 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TnikP83510 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TnikP83510 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TnikP83510 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TnikP83510 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TnikP83510 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TnikP83510 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TnikP83510 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
TnikP83510 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TnikP83510 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TnikP83510 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TnikP83510 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TnikP83510 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TnikP83510 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TnikP83510 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TnikP83510 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TnikP83510 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
TnikP83510 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TnikP83510 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TnikP83510 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TnikP83510 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TnikP83510 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TnikP83510 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TnikP83510 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TnikP83510 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TnikP83510 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TnikP83510 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TnikP83510 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TnikP83510 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TnikP83510 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TnikP83510 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TnikP83510 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TnikP83510 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TnikP83510 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TnikP83510 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TnikP83510 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TnikP83510 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TnikP83510 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TnikP83510 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms