Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf1P81269 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf1P81269 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf1P81269 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf1P81269 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf1P81269 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf1P81269 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf1P81269 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf1P81269 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf1P81269 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf1P81269 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atf1P81269 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf1P81269 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf1P81269 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf1P81269 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf1P81269 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf1P81269 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atf1P81269 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf1P81269 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf1P81269 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf1P81269 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf1P81269 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf1P81269 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf1P81269 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf1P81269 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf1P81269 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf1P81269 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf1P81269 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf1P81269 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf1P81269 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf1P81269 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf1P81269 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf1P81269 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf1P81269 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf1P81269 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf1P81269 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf1P81269 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf1P81269 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf1P81269 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf1P81269 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf1P81269 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf1P81269 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf1P81269 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atf1P81269 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf1P81269 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atf1P81269 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf1P81269 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf1P81269 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf1P81269 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf1P81269 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf1P81269 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf1P81269 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf1P81269 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf1P81269 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf1P81269 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf1P81269 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf1P81269 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf1P81269 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf1P81269 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf1P81269 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atf1P81269 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atf1P81269 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf1P81269 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf1P81269 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf1P81269 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf1P81269 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf1P81269 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf1P81269 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf1P81269 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf1P81269 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms