Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptprn2P80560 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptprn2P80560 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptprn2P80560 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptprn2P80560 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptprn2P80560 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptprn2P80560 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptprn2P80560 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptprn2P80560 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptprn2P80560 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptprn2P80560 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptprn2P80560 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptprn2P80560 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptprn2P80560 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptprn2P80560 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptprn2P80560 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptprn2P80560 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptprn2P80560 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ptprn2P80560 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ptprn2P80560 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ptprn2P80560 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptprn2P80560 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptprn2P80560 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptprn2P80560 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptprn2P80560 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptprn2P80560 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptprn2P80560 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ptprn2P80560 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptprn2P80560 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptprn2P80560 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptprn2P80560 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptprn2P80560 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptprn2P80560 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptprn2P80560 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptprn2P80560 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptprn2P80560 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptprn2P80560 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptprn2P80560 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptprn2P80560 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptprn2P80560 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptprn2P80560 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptprn2P80560 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptprn2P80560 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptprn2P80560 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptprn2P80560 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptprn2P80560 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptprn2P80560 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptprn2P80560 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptprn2P80560 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptprn2P80560 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptprn2P80560 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptprn2P80560 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptprn2P80560 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptprn2P80560 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms