Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otx1P80205 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otx1P80205 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otx1P80205 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otx1P80205 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otx1P80205 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otx1P80205 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otx1P80205 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otx1P80205 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otx1P80205 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otx1P80205 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Otx1P80205 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Otx1P80205 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otx1P80205 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otx1P80205 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otx1P80205 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otx1P80205 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otx1P80205 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otx1P80205 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otx1P80205 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otx1P80205 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otx1P80205 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otx1P80205 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otx1P80205 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otx1P80205 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otx1P80205 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otx1P80205 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otx1P80205 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otx1P80205 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Otx1P80205 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otx1P80205 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otx1P80205 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otx1P80205 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otx1P80205 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otx1P80205 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otx1P80205 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otx1P80205 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Otx1P80205 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otx1P80205 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otx1P80205 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Otx1P80205 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Otx1P80205 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Otx1P80205 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otx1P80205 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otx1P80205 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otx1P80205 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otx1P80205 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otx1P80205 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otx1P80205 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otx1P80205 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otx1P80205 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Otx1P80205 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx1P80205 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otx1P80205 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Otx1P80205 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otx1P80205 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Otx1P80205 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Otx1P80205 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otx1P80205 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otx1P80205 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.7 ms