Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casp4P70343 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casp4P70343 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp4P70343 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casp4P70343 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casp4P70343 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casp4P70343 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Casp4P70343 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp4P70343 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp4P70343 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp4P70343 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Casp4P70343 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Casp4P70343 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Casp4P70343 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Casp4P70343 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp4P70343 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp4P70343 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casp4P70343 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casp4P70343 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp4P70343 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp4P70343 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Casp4P70343 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Casp4P70343 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp4P70343 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp4P70343 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp4P70343 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Casp4P70343 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Casp4P70343 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Casp4P70343 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp4P70343 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Casp4P70343 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Casp4P70343 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp4P70343 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Casp4P70343 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Casp4P70343 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Casp4P70343 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Casp4P70343 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp4P70343 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Casp4P70343 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms