Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hmgb1P63158 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Hmgb1P63158 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hmgb1P63158 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hmgb1P63158 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hmgb1P63158 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hmgb1P63158 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hmgb1P63158 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hmgb1P63158 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hmgb1P63158 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hmgb1P63158 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hmgb1P63158 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hmgb1P63158 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hmgb1P63158 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hmgb1P63158 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hmgb1P63158 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hmgb1P63158 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Hmgb1P63158 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hmgb1P63158 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hmgb1P63158 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hmgb1P63158 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hmgb1P63158 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hmgb1P63158 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hmgb1P63158 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hmgb1P63158 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hmgb1P63158 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hmgb1P63158 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hmgb1P63158 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Hmgb1P63158 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hmgb1P63158 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hmgb1P63158 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hmgb1P63158 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hmgb1P63158 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hmgb1P63158 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hmgb1P63158 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hmgb1P63158 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hmgb1P63158 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hmgb1P63158 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hmgb1P63158 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hmgb1P63158 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hmgb1P63158 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hmgb1P63158 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Hmgb1P63158 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hmgb1P63158 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hmgb1P63158 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hmgb1P63158 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hmgb1P63158 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hmgb1P63158 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hmgb1P63158 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hmgb1P63158 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hmgb1P63158 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hmgb1P63158 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hmgb1P63158 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hmgb1P63158 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hmgb1P63158 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hmgb1P63158 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hmgb1P63158 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hmgb1P63158 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hmgb1P63158 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hmgb1P63158 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hmgb1P63158 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hmgb1P63158 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmgb1P63158 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmgb1P63158 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hmgb1P63158 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hmgb1P63158 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hmgb1P63158 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hmgb1P63158 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hmgb1P63158 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hmgb1P63158 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hmgb1P63158 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hmgb1P63158 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hmgb1P63158 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hmgb1P63158 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hmgb1P63158 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hmgb1P63158 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hmgb1P63158 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hmgb1P63158 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hmgb1P63158 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hmgb1P63158 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hmgb1P63158 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hmgb1P63158 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hmgb1P63158 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hmgb1P63158 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hmgb1P63158 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms