Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl39P62892 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl39P62892 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpl39P62892 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl39P62892 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl39P62892 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl39P62892 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms