Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Depdc5P61460 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Depdc5P61460 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Depdc5P61460 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Depdc5P61460 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Depdc5P61460 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Depdc5P61460 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Depdc5P61460 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Depdc5P61460 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Depdc5P61460 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Depdc5P61460 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Depdc5P61460 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Depdc5P61460 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Depdc5P61460 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Depdc5P61460 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Depdc5P61460 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Depdc5P61460 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Depdc5P61460 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Depdc5P61460 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Depdc5P61460 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Depdc5P61460 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Depdc5P61460 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Depdc5P61460 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Depdc5P61460 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Depdc5P61460 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Depdc5P61460 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Depdc5P61460 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Depdc5P61460 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Depdc5P61460 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Depdc5P61460 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Depdc5P61460 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Depdc5P61460 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Depdc5P61460 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Depdc5P61460 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Depdc5P61460 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Depdc5P61460 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Depdc5P61460 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Depdc5P61460 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Depdc5P61460 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Depdc5P61460 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Depdc5P61460 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Depdc5P61460 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Depdc5P61460 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Depdc5P61460 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Depdc5P61460 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Depdc5P61460 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Depdc5P61460 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Depdc5P61460 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Depdc5P61460 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Depdc5P61460 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Depdc5P61460 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Depdc5P61460 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Depdc5P61460 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Depdc5P61460 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Depdc5P61460 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Depdc5P61460 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Depdc5P61460 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Depdc5P61460 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Depdc5P61460 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Depdc5P61460 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Depdc5P61460 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Depdc5P61460 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Depdc5P61460 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Depdc5P61460 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Depdc5P61460 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Depdc5P61460 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Depdc5P61460 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Depdc5P61460 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Depdc5P61460 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Depdc5P61460 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Depdc5P61460 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Depdc5P61460 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Depdc5P61460 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Depdc5P61460 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Depdc5P61460 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Depdc5P61460 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Depdc5P61460 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Depdc5P61460 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Depdc5P61460 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Depdc5P61460 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Depdc5P61460 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Depdc5P61460 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Depdc5P61460 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Depdc5P61460 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Depdc5P61460 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms