Protein–RNA interactions for Protein: P60003

Elof1, Transcription elongation factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elof1P60003 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Elof1P60003 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Elof1P60003 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Elof1P60003 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elof1P60003 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Elof1P60003 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elof1P60003 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elof1P60003 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elof1P60003 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Elof1P60003 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Elof1P60003 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Elof1P60003 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Elof1P60003 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elof1P60003 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elof1P60003 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms