Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b6P59708 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b6P59708 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b6P59708 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b6P59708 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b6P59708 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b6P59708 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b6P59708 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b6P59708 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b6P59708 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b6P59708 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sf3b6P59708 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sf3b6P59708 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b6P59708 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sf3b6P59708 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sf3b6P59708 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b6P59708 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b6P59708 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b6P59708 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b6P59708 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sf3b6P59708 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b6P59708 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sf3b6P59708 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sf3b6P59708 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b6P59708 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sf3b6P59708 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b6P59708 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b6P59708 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sf3b6P59708 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b6P59708 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b6P59708 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b6P59708 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b6P59708 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b6P59708 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b6P59708 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b6P59708 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b6P59708 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b6P59708 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b6P59708 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b6P59708 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b6P59708 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b6P59708 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b6P59708 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b6P59708 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b6P59708 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b6P59708 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b6P59708 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b6P59708 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b6P59708 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sf3b6P59708 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sf3b6P59708 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b6P59708 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b6P59708 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b6P59708 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b6P59708 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b6P59708 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b6P59708 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b6P59708 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b6P59708 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b6P59708 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b6P59708 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b6P59708 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b6P59708 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sf3b6P59708 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sf3b6P59708 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b6P59708 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b6P59708 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b6P59708 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b6P59708 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b6P59708 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b6P59708 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b6P59708 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b6P59708 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b6P59708 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b6P59708 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b6P59708 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b6P59708 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b6P59708 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b6P59708 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b6P59708 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b6P59708 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b6P59708 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf3b6P59708 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sf3b6P59708 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sf3b6P59708 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sf3b6P59708 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b6P59708 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b6P59708 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b6P59708 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b6P59708 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b6P59708 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sf3b6P59708 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b6P59708 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms