Protein–RNA interactions for Protein: P59111

Kcnh8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnh8P59111 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Kcnh8P59111 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Kcnh8P59111 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Kcnh8P59111 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Kcnh8P59111 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31,7■■■□□ 2,66
Kcnh8P59111 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Kcnh8P59111 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Kcnh8P59111 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Kcnh8P59111 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Kcnh8P59111 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Kcnh8P59111 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Kcnh8P59111 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Kcnh8P59111 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Kcnh8P59111 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Kcnh8P59111 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31,63■■■□□ 2,65
Kcnh8P59111 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Kcnh8P59111 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Kcnh8P59111 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31,58■■■□□ 2,65
Kcnh8P59111 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,65
Kcnh8P59111 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Kcnh8P59111 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Kcnh8P59111 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Kcnh8P59111 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Kcnh8P59111 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Kcnh8P59111 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Kcnh8P59111 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Kcnh8P59111 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Kcnh8P59111 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Kcnh8P59111 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Kcnh8P59111 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Kcnh8P59111 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Kcnh8P59111 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31,5■■■□□ 2,63
Kcnh8P59111 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Kcnh8P59111 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Kcnh8P59111 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Kcnh8P59111 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Kcnh8P59111 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Kcnh8P59111 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31,47■■■□□ 2,63
Kcnh8P59111 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Kcnh8P59111 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Kcnh8P59111 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Kcnh8P59111 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Kcnh8P59111 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Kcnh8P59111 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Kcnh8P59111 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Kcnh8P59111 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Kcnh8P59111 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Kcnh8P59111 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Kcnh8P59111 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Kcnh8P59111 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31,42■■■□□ 2,62
Kcnh8P59111 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,42■■■□□ 2,62
Kcnh8P59111 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Kcnh8P59111 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Kcnh8P59111 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Kcnh8P59111 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Kcnh8P59111 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Kcnh8P59111 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Kcnh8P59111 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Kcnh8P59111 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Kcnh8P59111 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Kcnh8P59111 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31,34■■■□□ 2,61
Kcnh8P59111 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Kcnh8P59111 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Kcnh8P59111 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Kcnh8P59111 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Kcnh8P59111 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Kcnh8P59111 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Kcnh8P59111 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Kcnh8P59111 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Kcnh8P59111 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Kcnh8P59111 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,26■■■□□ 2,6
Kcnh8P59111 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31,26■■■□□ 2,59
Kcnh8P59111 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Kcnh8P59111 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Kcnh8P59111 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Kcnh8P59111 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Kcnh8P59111 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Kcnh8P59111 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Kcnh8P59111 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Kcnh8P59111 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Kcnh8P59111 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Kcnh8P59111 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Kcnh8P59111 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Kcnh8P59111 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Kcnh8P59111 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31,2■■■□□ 2,59
Kcnh8P59111 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Kcnh8P59111 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Kcnh8P59111 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Kcnh8P59111 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Kcnh8P59111 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Kcnh8P59111 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Kcnh8P59111 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Kcnh8P59111 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Kcnh8P59111 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Kcnh8P59111 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Kcnh8P59111 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Kcnh8P59111 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Kcnh8P59111 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Kcnh8P59111 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Kcnh8P59111 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms