Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ripk2P58801 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ripk2P58801 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ripk2P58801 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ripk2P58801 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ripk2P58801 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ripk2P58801 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ripk2P58801 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ripk2P58801 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ripk2P58801 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ripk2P58801 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ripk2P58801 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ripk2P58801 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ripk2P58801 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ripk2P58801 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ripk2P58801 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ripk2P58801 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ripk2P58801 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ripk2P58801 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ripk2P58801 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ripk2P58801 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ripk2P58801 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ripk2P58801 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ripk2P58801 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ripk2P58801 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ripk2P58801 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ripk2P58801 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ripk2P58801 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk2P58801 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk2P58801 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk2P58801 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk2P58801 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ripk2P58801 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ripk2P58801 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk2P58801 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk2P58801 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk2P58801 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk2P58801 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk2P58801 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ripk2P58801 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ripk2P58801 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk2P58801 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk2P58801 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk2P58801 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk2P58801 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk2P58801 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ripk2P58801 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms