Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox7bP56393 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox7bP56393 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox7bP56393 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox7bP56393 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms