Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PitpnbP53811 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PitpnbP53811 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PitpnbP53811 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PitpnbP53811 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PitpnbP53811 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PitpnbP53811 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PitpnbP53811 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PitpnbP53811 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PitpnbP53811 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PitpnbP53811 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PitpnbP53811 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PitpnbP53811 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PitpnbP53811 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PitpnbP53811 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PitpnbP53811 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PitpnbP53811 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PitpnbP53811 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PitpnbP53811 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PitpnbP53811 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PitpnbP53811 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PitpnbP53811 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PitpnbP53811 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PitpnbP53811 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PitpnbP53811 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PitpnbP53811 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PitpnbP53811 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PitpnbP53811 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms