Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FmodP50608 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FmodP50608 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FmodP50608 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FmodP50608 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FmodP50608 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FmodP50608 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FmodP50608 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FmodP50608 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FmodP50608 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FmodP50608 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FmodP50608 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FmodP50608 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FmodP50608 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FmodP50608 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FmodP50608 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FmodP50608 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FmodP50608 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FmodP50608 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FmodP50608 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FmodP50608 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FmodP50608 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FmodP50608 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FmodP50608 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FmodP50608 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FmodP50608 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FmodP50608 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FmodP50608 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FmodP50608 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FmodP50608 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FmodP50608 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FmodP50608 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FmodP50608 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FmodP50608 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FmodP50608 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FmodP50608 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FmodP50608 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FmodP50608 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FmodP50608 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FmodP50608 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FmodP50608 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FmodP50608 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FmodP50608 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FmodP50608 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FmodP50608 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FmodP50608 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FmodP50608 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FmodP50608 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FmodP50608 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FmodP50608 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FmodP50608 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FmodP50608 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FmodP50608 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FmodP50608 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FmodP50608 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FmodP50608 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FmodP50608 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FmodP50608 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FmodP50608 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FmodP50608 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FmodP50608 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FmodP50608 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FmodP50608 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FmodP50608 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FmodP50608 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FmodP50608 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FmodP50608 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FmodP50608 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FmodP50608 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FmodP50608 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FmodP50608 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FmodP50608 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FmodP50608 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FmodP50608 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FmodP50608 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FmodP50608 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FmodP50608 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FmodP50608 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FmodP50608 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FmodP50608 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FmodP50608 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FmodP50608 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FmodP50608 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FmodP50608 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FmodP50608 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FmodP50608 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FmodP50608 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FmodP50608 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FmodP50608 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FmodP50608 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FmodP50608 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FmodP50608 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FmodP50608 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FmodP50608 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FmodP50608 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FmodP50608 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FmodP50608 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FmodP50608 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FmodP50608 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FmodP50608 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms