Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prox1P48437 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prox1P48437 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prox1P48437 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prox1P48437 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prox1P48437 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prox1P48437 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prox1P48437 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prox1P48437 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prox1P48437 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prox1P48437 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prox1P48437 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prox1P48437 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prox1P48437 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prox1P48437 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prox1P48437 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prox1P48437 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prox1P48437 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prox1P48437 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prox1P48437 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prox1P48437 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prox1P48437 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prox1P48437 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prox1P48437 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prox1P48437 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prox1P48437 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prox1P48437 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prox1P48437 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prox1P48437 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prox1P48437 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prox1P48437 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prox1P48437 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prox1P48437 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prox1P48437 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms