Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rfx1P48377 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rfx1P48377 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rfx1P48377 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rfx1P48377 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rfx1P48377 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rfx1P48377 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rfx1P48377 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Rfx1P48377 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rfx1P48377 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rfx1P48377 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rfx1P48377 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rfx1P48377 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rfx1P48377 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rfx1P48377 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rfx1P48377 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rfx1P48377 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rfx1P48377 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rfx1P48377 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rfx1P48377 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rfx1P48377 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rfx1P48377 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rfx1P48377 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rfx1P48377 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rfx1P48377 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rfx1P48377 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rfx1P48377 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx1P48377 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx1P48377 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rfx1P48377 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rfx1P48377 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Rfx1P48377 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rfx1P48377 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rfx1P48377 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rfx1P48377 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rfx1P48377 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rfx1P48377 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rfx1P48377 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rfx1P48377 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rfx1P48377 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rfx1P48377 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rfx1P48377 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rfx1P48377 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rfx1P48377 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rfx1P48377 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rfx1P48377 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rfx1P48377 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rfx1P48377 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Rfx1P48377 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rfx1P48377 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rfx1P48377 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rfx1P48377 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rfx1P48377 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rfx1P48377 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rfx1P48377 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rfx1P48377 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rfx1P48377 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rfx1P48377 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rfx1P48377 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rfx1P48377 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rfx1P48377 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rfx1P48377 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rfx1P48377 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rfx1P48377 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rfx1P48377 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rfx1P48377 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rfx1P48377 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rfx1P48377 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rfx1P48377 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rfx1P48377 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rfx1P48377 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rfx1P48377 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Rfx1P48377 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rfx1P48377 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rfx1P48377 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rfx1P48377 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rfx1P48377 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rfx1P48377 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rfx1P48377 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rfx1P48377 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rfx1P48377 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx1P48377 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rfx1P48377 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rfx1P48377 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rfx1P48377 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rfx1P48377 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rfx1P48377 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms