Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax7P47239 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pax7P47239 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pax7P47239 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pax7P47239 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pax7P47239 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pax7P47239 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pax7P47239 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pax7P47239 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pax7P47239 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pax7P47239 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pax7P47239 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pax7P47239 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pax7P47239 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pax7P47239 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pax7P47239 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pax7P47239 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pax7P47239 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pax7P47239 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pax7P47239 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pax7P47239 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pax7P47239 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pax7P47239 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pax7P47239 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pax7P47239 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pax7P47239 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pax7P47239 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pax7P47239 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pax7P47239 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pax7P47239 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pax7P47239 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pax7P47239 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pax7P47239 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pax7P47239 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pax7P47239 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pax7P47239 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pax7P47239 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax7P47239 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax7P47239 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax7P47239 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax7P47239 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax7P47239 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax7P47239 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pax7P47239 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pax7P47239 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax7P47239 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax7P47239 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pax7P47239 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms