Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sipa1P46062 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sipa1P46062 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sipa1P46062 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sipa1P46062 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sipa1P46062 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sipa1P46062 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sipa1P46062 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sipa1P46062 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sipa1P46062 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sipa1P46062 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sipa1P46062 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sipa1P46062 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sipa1P46062 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sipa1P46062 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sipa1P46062 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sipa1P46062 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sipa1P46062 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sipa1P46062 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sipa1P46062 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sipa1P46062 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sipa1P46062 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sipa1P46062 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sipa1P46062 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sipa1P46062 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sipa1P46062 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sipa1P46062 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sipa1P46062 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sipa1P46062 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sipa1P46062 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sipa1P46062 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sipa1P46062 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sipa1P46062 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sipa1P46062 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sipa1P46062 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms