Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmx2P43687 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmx2P43687 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmx2P43687 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmx2P43687 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmx2P43687 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmx2P43687 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmx2P43687 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmx2P43687 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmx2P43687 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmx2P43687 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmx2P43687 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmx2P43687 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmx2P43687 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmx2P43687 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmx2P43687 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmx2P43687 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmx2P43687 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmx2P43687 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmx2P43687 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmx2P43687 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hmx2P43687 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmx2P43687 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmx2P43687 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmx2P43687 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmx2P43687 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmx2P43687 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmx2P43687 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmx2P43687 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmx2P43687 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmx2P43687 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hmx2P43687 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hmx2P43687 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hmx2P43687 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmx2P43687 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hmx2P43687 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmx2P43687 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmx2P43687 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmx2P43687 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmx2P43687 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmx2P43687 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmx2P43687 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmx2P43687 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmx2P43687 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmx2P43687 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmx2P43687 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmx2P43687 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmx2P43687 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmx2P43687 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmx2P43687 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmx2P43687 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmx2P43687 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmx2P43687 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmx2P43687 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmx2P43687 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmx2P43687 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmx2P43687 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmx2P43687 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmx2P43687 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmx2P43687 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmx2P43687 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmx2P43687 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmx2P43687 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmx2P43687 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmx2P43687 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmx2P43687 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmx2P43687 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmx2P43687 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmx2P43687 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmx2P43687 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmx2P43687 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmx2P43687 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmx2P43687 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hmx2P43687 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmx2P43687 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmx2P43687 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmx2P43687 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmx2P43687 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmx2P43687 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmx2P43687 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmx2P43687 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmx2P43687 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmx2P43687 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmx2P43687 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmx2P43687 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmx2P43687 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms