Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ItgavP43406 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ItgavP43406 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ItgavP43406 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ItgavP43406 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ItgavP43406 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ItgavP43406 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ItgavP43406 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ItgavP43406 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ItgavP43406 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ItgavP43406 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ItgavP43406 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ItgavP43406 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ItgavP43406 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ItgavP43406 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ItgavP43406 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ItgavP43406 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ItgavP43406 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ItgavP43406 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ItgavP43406 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ItgavP43406 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ItgavP43406 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ItgavP43406 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ItgavP43406 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ItgavP43406 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ItgavP43406 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ItgavP43406 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ItgavP43406 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ItgavP43406 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ItgavP43406 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ItgavP43406 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ItgavP43406 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ItgavP43406 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ItgavP43406 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ItgavP43406 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ItgavP43406 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ItgavP43406 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ItgavP43406 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ItgavP43406 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ItgavP43406 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ItgavP43406 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ItgavP43406 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ItgavP43406 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ItgavP43406 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ItgavP43406 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ItgavP43406 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ItgavP43406 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ItgavP43406 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ItgavP43406 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ItgavP43406 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ItgavP43406 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ItgavP43406 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ItgavP43406 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ItgavP43406 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ItgavP43406 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ItgavP43406 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ItgavP43406 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ItgavP43406 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ItgavP43406 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ItgavP43406 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms