Protein–RNA interactions for Protein: P43252

Ptgir, Prostacyclin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgirP43252 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtgirP43252 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtgirP43252 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtgirP43252 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtgirP43252 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtgirP43252 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtgirP43252 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgirP43252 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgirP43252 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgirP43252 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgirP43252 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgirP43252 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgirP43252 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgirP43252 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgirP43252 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgirP43252 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtgirP43252 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PtgirP43252 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtgirP43252 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtgirP43252 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtgirP43252 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtgirP43252 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PtgirP43252 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtgirP43252 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtgirP43252 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtgirP43252 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtgirP43252 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtgirP43252 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtgirP43252 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtgirP43252 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtgirP43252 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtgirP43252 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtgirP43252 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtgirP43252 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtgirP43252 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtgirP43252 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtgirP43252 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtgirP43252 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtgirP43252 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtgirP43252 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtgirP43252 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtgirP43252 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms