Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtgfrP43117 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtgfrP43117 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtgfrP43117 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PtgfrP43117 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtgfrP43117 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtgfrP43117 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtgfrP43117 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgfrP43117 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtgfrP43117 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtgfrP43117 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgfrP43117 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtgfrP43117 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgfrP43117 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtgfrP43117 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtgfrP43117 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtgfrP43117 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtgfrP43117 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtgfrP43117 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtgfrP43117 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtgfrP43117 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtgfrP43117 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtgfrP43117 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtgfrP43117 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtgfrP43117 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtgfrP43117 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PtgfrP43117 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtgfrP43117 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtgfrP43117 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtgfrP43117 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtgfrP43117 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtgfrP43117 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtgfrP43117 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtgfrP43117 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtgfrP43117 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtgfrP43117 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtgfrP43117 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtgfrP43117 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtgfrP43117 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtgfrP43117 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtgfrP43117 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtgfrP43117 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtgfrP43117 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms