Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gdf5P43027 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gdf5P43027 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gdf5P43027 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gdf5P43027 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gdf5P43027 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gdf5P43027 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gdf5P43027 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gdf5P43027 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gdf5P43027 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gdf5P43027 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gdf5P43027 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gdf5P43027 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gdf5P43027 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gdf5P43027 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gdf5P43027 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gdf5P43027 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gdf5P43027 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gdf5P43027 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gdf5P43027 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gdf5P43027 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gdf5P43027 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gdf5P43027 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gdf5P43027 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gdf5P43027 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gdf5P43027 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gdf5P43027 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gdf5P43027 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gdf5P43027 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gdf5P43027 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gdf5P43027 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gdf5P43027 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gdf5P43027 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gdf5P43027 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gdf5P43027 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gdf5P43027 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gdf5P43027 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gdf5P43027 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gdf5P43027 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gdf5P43027 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gdf5P43027 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gdf5P43027 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gdf5P43027 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gdf5P43027 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gdf5P43027 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf5P43027 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf5P43027 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gdf5P43027 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gdf5P43027 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdf5P43027 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdf5P43027 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf5P43027 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gdf5P43027 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gdf5P43027 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdf5P43027 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdf5P43027 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdf5P43027 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gdf5P43027 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gdf5P43027 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gdf5P43027 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gdf5P43027 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gdf5P43027 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gdf5P43027 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gdf5P43027 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gdf5P43027 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gdf5P43027 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gdf5P43027 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gdf5P43027 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gdf5P43027 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gdf5P43027 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms