Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clec3bP43025 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clec3bP43025 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clec3bP43025 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clec3bP43025 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clec3bP43025 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clec3bP43025 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clec3bP43025 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clec3bP43025 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clec3bP43025 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Clec3bP43025 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clec3bP43025 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clec3bP43025 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clec3bP43025 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clec3bP43025 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clec3bP43025 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Clec3bP43025 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Clec3bP43025 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Clec3bP43025 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clec3bP43025 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clec3bP43025 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clec3bP43025 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clec3bP43025 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clec3bP43025 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clec3bP43025 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clec3bP43025 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clec3bP43025 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clec3bP43025 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clec3bP43025 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Clec3bP43025 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clec3bP43025 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clec3bP43025 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clec3bP43025 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms