Protein–RNA interactions for Protein: P43023

Cox6a2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a2P43023 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a2P43023 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a2P43023 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a2P43023 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a2P43023 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a2P43023 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a2P43023 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a2P43023 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a2P43023 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a2P43023 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a2P43023 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6a2P43023 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a2P43023 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a2P43023 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6a2P43023 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a2P43023 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a2P43023 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a2P43023 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a2P43023 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6a2P43023 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a2P43023 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6a2P43023 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cox6a2P43023 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox6a2P43023 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox6a2P43023 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6a2P43023 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a2P43023 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a2P43023 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6a2P43023 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6a2P43023 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6a2P43023 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6a2P43023 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6a2P43023 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6a2P43023 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6a2P43023 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6a2P43023 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cox6a2P43023 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms