Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc19a1P41438 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc19a1P41438 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc19a1P41438 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc19a1P41438 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc19a1P41438 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc19a1P41438 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc19a1P41438 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc19a1P41438 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc19a1P41438 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc19a1P41438 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc19a1P41438 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc19a1P41438 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc19a1P41438 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc19a1P41438 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc19a1P41438 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc19a1P41438 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc19a1P41438 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc19a1P41438 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc19a1P41438 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc19a1P41438 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc19a1P41438 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc19a1P41438 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc19a1P41438 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc19a1P41438 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc19a1P41438 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc19a1P41438 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc19a1P41438 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc19a1P41438 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc19a1P41438 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc19a1P41438 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc19a1P41438 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc19a1P41438 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc19a1P41438 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc19a1P41438 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc19a1P41438 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc19a1P41438 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc19a1P41438 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc19a1P41438 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc19a1P41438 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc19a1P41438 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc19a1P41438 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc19a1P41438 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc19a1P41438 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc19a1P41438 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc19a1P41438 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc19a1P41438 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc19a1P41438 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc19a1P41438 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc19a1P41438 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc19a1P41438 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc19a1P41438 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc19a1P41438 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc19a1P41438 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc19a1P41438 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc19a1P41438 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc19a1P41438 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc19a1P41438 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc19a1P41438 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc19a1P41438 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc19a1P41438 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc19a1P41438 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc19a1P41438 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc19a1P41438 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc19a1P41438 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc19a1P41438 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc19a1P41438 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc19a1P41438 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc19a1P41438 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc19a1P41438 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc19a1P41438 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc19a1P41438 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc19a1P41438 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc19a1P41438 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc19a1P41438 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc19a1P41438 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc19a1P41438 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc19a1P41438 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Slc19a1P41438 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms