Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LtbP41155 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbP41155 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbP41155 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LtbP41155 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LtbP41155 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LtbP41155 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LtbP41155 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LtbP41155 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LtbP41155 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LtbP41155 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LtbP41155 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LtbP41155 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LtbP41155 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LtbP41155 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LtbP41155 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LtbP41155 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbP41155 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LtbP41155 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LtbP41155 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LtbP41155 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LtbP41155 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbP41155 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LtbP41155 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LtbP41155 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LtbP41155 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LtbP41155 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LtbP41155 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LtbP41155 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LtbP41155 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LtbP41155 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LtbP41155 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LtbP41155 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LtbP41155 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LtbP41155 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LtbP41155 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LtbP41155 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LtbP41155 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LtbP41155 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LtbP41155 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LtbP41155 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LtbP41155 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LtbP41155 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LtbP41155 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LtbP41155 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LtbP41155 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LtbP41155 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LtbP41155 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LtbP41155 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LtbP41155 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LtbP41155 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LtbP41155 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbP41155 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LtbP41155 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LtbP41155 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LtbP41155 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LtbP41155 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LtbP41155 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbP41155 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbP41155 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbP41155 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LtbP41155 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LtbP41155 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbP41155 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbP41155 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbP41155 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbP41155 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbP41155 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbP41155 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbP41155 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbP41155 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbP41155 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbP41155 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbP41155 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbP41155 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbP41155 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbP41155 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LtbP41155 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LtbP41155 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LtbP41155 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LtbP41155 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LtbP41155 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LtbP41155 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LtbP41155 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LtbP41155 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LtbP41155 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LtbP41155 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LtbP41155 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LtbP41155 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LtbP41155 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LtbP41155 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LtbP41155 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LtbP41155 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LtbP41155 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LtbP41155 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LtbP41155 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LtbP41155 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LtbP41155 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LtbP41155 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LtbP41155 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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