Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ighmbp2P40694 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ighmbp2P40694 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ighmbp2P40694 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ighmbp2P40694 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ighmbp2P40694 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ighmbp2P40694 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ighmbp2P40694 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ighmbp2P40694 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ighmbp2P40694 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ighmbp2P40694 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ighmbp2P40694 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ighmbp2P40694 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ighmbp2P40694 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ighmbp2P40694 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ighmbp2P40694 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ighmbp2P40694 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ighmbp2P40694 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ighmbp2P40694 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ighmbp2P40694 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ighmbp2P40694 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ighmbp2P40694 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ighmbp2P40694 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ighmbp2P40694 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ighmbp2P40694 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ighmbp2P40694 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ighmbp2P40694 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ighmbp2P40694 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ighmbp2P40694 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ighmbp2P40694 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ighmbp2P40694 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ighmbp2P40694 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ighmbp2P40694 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Ighmbp2P40694 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ighmbp2P40694 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ighmbp2P40694 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ighmbp2P40694 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ighmbp2P40694 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ighmbp2P40694 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ighmbp2P40694 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ighmbp2P40694 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ighmbp2P40694 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ighmbp2P40694 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ighmbp2P40694 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ighmbp2P40694 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ighmbp2P40694 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ighmbp2P40694 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ighmbp2P40694 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ighmbp2P40694 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ighmbp2P40694 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ighmbp2P40694 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ighmbp2P40694 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ighmbp2P40694 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ighmbp2P40694 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ighmbp2P40694 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ighmbp2P40694 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ighmbp2P40694 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ighmbp2P40694 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ighmbp2P40694 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ighmbp2P40694 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ighmbp2P40694 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ighmbp2P40694 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ighmbp2P40694 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms