Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TfamP40630 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TfamP40630 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TfamP40630 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TfamP40630 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TfamP40630 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TfamP40630 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TfamP40630 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TfamP40630 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TfamP40630 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TfamP40630 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TfamP40630 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TfamP40630 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TfamP40630 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TfamP40630 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TfamP40630 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TfamP40630 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TfamP40630 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TfamP40630 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TfamP40630 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TfamP40630 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TfamP40630 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TfamP40630 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TfamP40630 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TfamP40630 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TfamP40630 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TfamP40630 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TfamP40630 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TfamP40630 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TfamP40630 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TfamP40630 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TfamP40630 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TfamP40630 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TfamP40630 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TfamP40630 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TfamP40630 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TfamP40630 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TfamP40630 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TfamP40630 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TfamP40630 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TfamP40630 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TfamP40630 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TfamP40630 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TfamP40630 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TfamP40630 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TfamP40630 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TfamP40630 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TfamP40630 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TfamP40630 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TfamP40630 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TfamP40630 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TfamP40630 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TfamP40630 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TfamP40630 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TfamP40630 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TfamP40630 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TfamP40630 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TfamP40630 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TfamP40630 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TfamP40630 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TfamP40630 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TfamP40630 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TfamP40630 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TfamP40630 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TfamP40630 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TfamP40630 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TfamP40630 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TfamP40630 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TfamP40630 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TfamP40630 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TfamP40630 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TfamP40630 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TfamP40630 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TfamP40630 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TfamP40630 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TfamP40630 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TfamP40630 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TfamP40630 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TfamP40630 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TfamP40630 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TfamP40630 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TfamP40630 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TfamP40630 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TfamP40630 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TfamP40630 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TfamP40630 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TfamP40630 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TfamP40630 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TfamP40630 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TfamP40630 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TfamP40630 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TfamP40630 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TfamP40630 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TfamP40630 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TfamP40630 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TfamP40630 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TfamP40630 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TfamP40630 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TfamP40630 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TfamP40630 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms