Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd9P40240 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd9P40240 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd9P40240 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd9P40240 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd9P40240 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd9P40240 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd9P40240 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd9P40240 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd9P40240 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd9P40240 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd9P40240 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd9P40240 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd9P40240 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd9P40240 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd9P40240 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd9P40240 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd9P40240 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd9P40240 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd9P40240 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd9P40240 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd9P40240 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd9P40240 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd9P40240 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd9P40240 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd9P40240 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd9P40240 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd9P40240 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd9P40240 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd9P40240 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd9P40240 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cd9P40240 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd9P40240 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd9P40240 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd9P40240 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd9P40240 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd9P40240 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd9P40240 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd9P40240 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Cd9P40240 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd9P40240 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd9P40240 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd9P40240 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd9P40240 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd9P40240 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd9P40240 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd9P40240 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd9P40240 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd9P40240 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd9P40240 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd9P40240 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd9P40240 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd9P40240 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd9P40240 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd9P40240 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd9P40240 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd9P40240 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd9P40240 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd9P40240 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd9P40240 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd9P40240 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd9P40240 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd9P40240 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd9P40240 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cd9P40240 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd9P40240 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd9P40240 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd9P40240 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd9P40240 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd9P40240 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd9P40240 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd9P40240 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms