Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PpardP35396 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PpardP35396 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PpardP35396 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PpardP35396 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PpardP35396 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PpardP35396 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PpardP35396 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PpardP35396 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PpardP35396 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PpardP35396 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PpardP35396 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PpardP35396 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PpardP35396 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PpardP35396 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PpardP35396 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PpardP35396 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PpardP35396 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PpardP35396 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PpardP35396 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PpardP35396 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PpardP35396 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PpardP35396 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PpardP35396 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PpardP35396 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PpardP35396 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PpardP35396 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PpardP35396 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PpardP35396 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PpardP35396 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PpardP35396 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PpardP35396 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PpardP35396 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PpardP35396 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PpardP35396 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PpardP35396 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PpardP35396 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PpardP35396 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PpardP35396 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PpardP35396 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PpardP35396 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PpardP35396 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PpardP35396 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PpardP35396 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PpardP35396 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PpardP35396 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PpardP35396 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PpardP35396 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PpardP35396 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PpardP35396 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PpardP35396 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PpardP35396 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PpardP35396 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PpardP35396 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PpardP35396 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PpardP35396 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PpardP35396 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PpardP35396 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PpardP35396 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PpardP35396 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PpardP35396 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PpardP35396 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PpardP35396 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PpardP35396 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PpardP35396 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PpardP35396 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PpardP35396 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PpardP35396 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PpardP35396 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PpardP35396 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PpardP35396 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PpardP35396 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PpardP35396 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PpardP35396 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PpardP35396 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PpardP35396 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PpardP35396 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PpardP35396 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PpardP35396 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PpardP35396 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PpardP35396 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PpardP35396 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PpardP35396 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PpardP35396 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PpardP35396 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PpardP35396 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PpardP35396 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PpardP35396 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PpardP35396 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PpardP35396 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PpardP35396 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PpardP35396 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PpardP35396 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PpardP35396 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PpardP35396 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PpardP35396 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PpardP35396 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PpardP35396 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PpardP35396 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PpardP35396 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms