Protein–RNA interactions for Protein: P35283

Rab12, Ras-related protein Rab-12, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab12P35283 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab12P35283 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab12P35283 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab12P35283 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab12P35283 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab12P35283 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab12P35283 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab12P35283 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab12P35283 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab12P35283 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab12P35283 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab12P35283 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab12P35283 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab12P35283 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab12P35283 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab12P35283 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab12P35283 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab12P35283 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab12P35283 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab12P35283 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab12P35283 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab12P35283 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab12P35283 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab12P35283 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab12P35283 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab12P35283 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab12P35283 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab12P35283 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab12P35283 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms