Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pola2P33611 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pola2P33611 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pola2P33611 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pola2P33611 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pola2P33611 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pola2P33611 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pola2P33611 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pola2P33611 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pola2P33611 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pola2P33611 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pola2P33611 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pola2P33611 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Pola2P33611 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pola2P33611 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pola2P33611 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pola2P33611 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pola2P33611 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pola2P33611 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pola2P33611 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pola2P33611 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pola2P33611 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pola2P33611 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Pola2P33611 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pola2P33611 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Pola2P33611 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pola2P33611 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pola2P33611 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pola2P33611 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pola2P33611 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pola2P33611 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pola2P33611 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pola2P33611 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pola2P33611 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pola2P33611 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pola2P33611 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pola2P33611 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pola2P33611 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pola2P33611 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pola2P33611 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pola2P33611 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pola2P33611 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pola2P33611 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pola2P33611 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pola2P33611 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pola2P33611 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pola2P33611 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pola2P33611 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Pola2P33611 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pola2P33611 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pola2P33611 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pola2P33611 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pola2P33611 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pola2P33611 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pola2P33611 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pola2P33611 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pola2P33611 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pola2P33611 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pola2P33611 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pola2P33611 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pola2P33611 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pola2P33611 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pola2P33611 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pola2P33611 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pola2P33611 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pola2P33611 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pola2P33611 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pola2P33611 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pola2P33611 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pola2P33611 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pola2P33611 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pola2P33611 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pola2P33611 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pola2P33611 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pola2P33611 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pola2P33611 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pola2P33611 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pola2P33611 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pola2P33611 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pola2P33611 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pola2P33611 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Pola2P33611 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pola2P33611 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pola2P33611 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pola2P33611 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pola2P33611 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pola2P33611 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pola2P33611 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pola2P33611 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pola2P33611 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pola2P33611 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pola2P33611 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pola2P33611 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pola2P33611 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Pola2P33611 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pola2P33611 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pola2P33611 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pola2P33611 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pola2P33611 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pola2P33611 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms