Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdh15P33146 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdh15P33146 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdh15P33146 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdh15P33146 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdh15P33146 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdh15P33146 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdh15P33146 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdh15P33146 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdh15P33146 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdh15P33146 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdh15P33146 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdh15P33146 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdh15P33146 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdh15P33146 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdh15P33146 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdh15P33146 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdh15P33146 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdh15P33146 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdh15P33146 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdh15P33146 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdh15P33146 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdh15P33146 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdh15P33146 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdh15P33146 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdh15P33146 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdh15P33146 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdh15P33146 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdh15P33146 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdh15P33146 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdh15P33146 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdh15P33146 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdh15P33146 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdh15P33146 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdh15P33146 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdh15P33146 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdh15P33146 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdh15P33146 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdh15P33146 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdh15P33146 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdh15P33146 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdh15P33146 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdh15P33146 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdh15P33146 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdh15P33146 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdh15P33146 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdh15P33146 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdh15P33146 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdh15P33146 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdh15P33146 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdh15P33146 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdh15P33146 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdh15P33146 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdh15P33146 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdh15P33146 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdh15P33146 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdh15P33146 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdh15P33146 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdh15P33146 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdh15P33146 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdh15P33146 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdh15P33146 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdh15P33146 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdh15P33146 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdh15P33146 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdh15P33146 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdh15P33146 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdh15P33146 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cdh15P33146 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdh15P33146 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms